Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrbP28704 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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