Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms