Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa5P28312 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa5P28312 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa5P28312 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms