Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LoxP28301 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LoxP28301 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LoxP28301 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LoxP28301 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LoxP28301 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LoxP28301 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LoxP28301 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LoxP28301 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LoxP28301 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LoxP28301 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LoxP28301 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LoxP28301 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LoxP28301 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LoxP28301 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LoxP28301 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LoxP28301 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms