Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lef1P27782 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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