Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Xrcc5P27641 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Xrcc5P27641 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Xrcc5P27641 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Xrcc5P27641 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Xrcc5P27641 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Xrcc5P27641 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Xrcc5P27641 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Xrcc5P27641 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Xrcc5P27641 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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