Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CftrP26361 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CftrP26361 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CftrP26361 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CftrP26361 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CftrP26361 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CftrP26361 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CftrP26361 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CftrP26361 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CftrP26361 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CftrP26361 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CftrP26361 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CftrP26361 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CftrP26361 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CftrP26361 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CftrP26361 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CftrP26361 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CftrP26361 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CftrP26361 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CftrP26361 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CftrP26361 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CftrP26361 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CftrP26361 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CftrP26361 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CftrP26361 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CftrP26361 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CftrP26361 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CftrP26361 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CftrP26361 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CftrP26361 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CftrP26361 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CftrP26361 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CftrP26361 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CftrP26361 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CftrP26361 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CftrP26361 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CftrP26361 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CftrP26361 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CftrP26361 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CftrP26361 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CftrP26361 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CftrP26361 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CftrP26361 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CftrP26361 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CftrP26361 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CftrP26361 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CftrP26361 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CftrP26361 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CftrP26361 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CftrP26361 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CftrP26361 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CftrP26361 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CftrP26361 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CftrP26361 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CftrP26361 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CftrP26361 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CftrP26361 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CftrP26361 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CftrP26361 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CftrP26361 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CftrP26361 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CftrP26361 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CftrP26361 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CftrP26361 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CftrP26361 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CftrP26361 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CftrP26361 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CftrP26361 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CftrP26361 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CftrP26361 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CftrP26361 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CftrP26361 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CftrP26361 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CftrP26361 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CftrP26361 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CftrP26361 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CftrP26361 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CftrP26361 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CftrP26361 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CftrP26361 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CftrP26361 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CftrP26361 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CftrP26361 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CftrP26361 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CftrP26361 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CftrP26361 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CftrP26361 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CftrP26361 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CftrP26361 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CftrP26361 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CftrP26361 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CftrP26361 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CftrP26361 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CftrP26361 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CftrP26361 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CftrP26361 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CftrP26361 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CftrP26361 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CftrP26361 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CftrP26361 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms