Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms