Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18530 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18530 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18530 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18530 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18530 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18530 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18530 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18530 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms