Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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