Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgbP16014 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgbP16014 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChgbP16014 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgbP16014 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms