Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms