Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spta1P08032 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms