Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06320 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06320 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06320 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06320 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06320 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06320 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06320 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06320 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06320 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06320 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06320 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06320 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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