Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JunP05627 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JunP05627 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JunP05627 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
JunP05627 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
JunP05627 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
JunP05627 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JunP05627 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JunP05627 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JunP05627 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JunP05627 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
JunP05627 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JunP05627 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JunP05627 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
JunP05627 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JunP05627 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JunP05627 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JunP05627 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JunP05627 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms