Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms