Protein–RNA interactions for Protein: P01897

H2-L, H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-LP01897 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-LP01897 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-LP01897 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-LP01897 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms