Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01809 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01809 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01809 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01809 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01809 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01809 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01809 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01809 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01809 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01809 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01809 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01809 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01809 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms