Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01667 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01667 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01667 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01667 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01667 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01667 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01667 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01667 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01667 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01667 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01667 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01667 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01667 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01667 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01667 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01667 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01667 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01667 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01667 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01667 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01667 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01667 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01667 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01667 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01667 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01667 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01667 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01667 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01667 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01667 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01667 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01667 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01667 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01667 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01667 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01667 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01667 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01667 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01667 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01667 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01667 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms