Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01641 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01641 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01641 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms