Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mtatp6P00848 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mtatp6P00848 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms