Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcn2O88968 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms