Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1O88746 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1O88746 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1O88746 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1O88746 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1O88746 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1O88746 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1O88746 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms