Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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