Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns1O88456 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns1O88456 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms