Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad51dO55230 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms