Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms