Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6bO54951 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6bO54951 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6bO54951 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6bO54951 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6bO54951 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6bO54951 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6bO54951 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6bO54951 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6bO54951 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6bO54951 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6bO54951 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sema6bO54951 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sema6bO54951 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema6bO54951 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms