Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pik3cdO35904 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pik3cdO35904 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pik3cdO35904 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pik3cdO35904 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pik3cdO35904 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pik3cdO35904 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pik3cdO35904 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pik3cdO35904 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pik3cdO35904 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pik3cdO35904 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pik3cdO35904 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pik3cdO35904 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pik3cdO35904 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pik3cdO35904 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pik3cdO35904 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms