Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms