Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cnih1O35372 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cnih1O35372 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cnih1O35372 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cnih1O35372 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cnih1O35372 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cnih1O35372 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnih1O35372 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Cnih1O35372 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms