Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad6O35182 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad6O35182 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad6O35182 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms