Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms