Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms