Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17078M0QW51 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17078M0QW51 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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