Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm8888J3QPX5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm8888J3QPX5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm8888J3QPX5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm8888J3QPX5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm8888J3QPX5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm8888J3QPX5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm8888J3QPX5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm8888J3QPX5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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