Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms