Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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