Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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