Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms