Protein–RNA interactions for Protein: G3XA45

Vmn2r69, MCG59833, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r69G3XA45 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r69G3XA45 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r69G3XA45 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r69G3XA45 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms