Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms