Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms