Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms