Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Farp1F8VPU2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms