Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8005F6YKY3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm8005F6YKY3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms