Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms