Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms