Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rdh16f1E9Q9P8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rdh16f1E9Q9P8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rdh16f1E9Q9P8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rdh16f1E9Q9P8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rdh16f1E9Q9P8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rdh16f1E9Q9P8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rdh16f1E9Q9P8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rdh16f1E9Q9P8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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