Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrdnE9Q9K5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms